Po wybraniu opcji np. Zapisz >'Zapisz na dysku plik PDF z e-podpisem', należy wybrać opcję 'Podpisz pliki aplikacją zewnętrną (np. proCertum Smart Sign)'.
A następnie po naciśnięciu 'Dodaj podpis', należy postępować wg instrukcji:
1. Otworzy się program do e-podpisu (proCertum Smart Sign).
2. Podpisz plik klikając opcję 'Podpisz' i wybierając właściwy certyfikat.
3. Po podpisaniu wróć do Programu e-pity i naciśnij klawisz 'Dalej'.
Jeśli podpis nie zostanie wykonany, program powróci do dialogu z instrukcją. Aby wyjść bez podpisywania, należy nacisnąć 'Anuluj'.